Mulan est une jeune fille de bonne famille, qui soucieuse pour son père ce travestira en homme et prendra sa place dans la guerre. Découverte par son mentor et général elle sera bannis de sa patris.
De ce jours elle parcourra les monde pour ce perfectionner dans l'art de la chevalerie, son rêve étant de regagner son pays et de prouver sa valeur à force de labeur.

Dans le conte, Mulan est une jeune villageoise ayant prit les armes pour éviter à son père d'être envoyé au combat et ainsi, se battre à sa place. Elle s'est donc fait passer pour un homme afin d'intégrer l'armée aux côtés des autres soldats et affronter les Huns.

Dans sa guerre contre le pays du soleil levant Shang Yu n'a pas de limite. Il cherche à atteindre l'empereur à tout pris et ce rapproche de son but. Peu à peu il décime l'armée royale sous les regard impuissant des soldat. Assoiffée de sans et de pouvoir c'est à ce demander si il y à un cœur et une âme dans cette coquille vide.

Dans les paysages montagneux de Chine, surplombés par la grande muraille, les Huns envahissent en pleine nuit le pays. L’empereur prévenu, décrète la mobilisation d’un homme par famille. Fa Mulan, fille unique, part en ville se préparer avec sa mère et sa grand-mère pour rencontrer la marieuse et faire ainsi honneur à sa famille. Sa grand-mère lui donne pour l’occasion Cri-Kee, un criquet porte bonheur. Cependant, après avoir commis maladresse sur maladresse, Mulan est honnie par la marieuse. De retour chez elle, seule, elle retire son maquillage et s’interroge sur la place qu’elle doit tenir.
Son père Fa-Zhou, la console en faisant allusion à la fleur de cerisier en retard mais ils sont interrompus par les tambours battants annonçant la conscription des hommes. Mulan s’oppose à son départ à la guerre invoquant sa maladie. Dans la nuit orageuse qui suit, elle se coupe les cheveux avec une épée et prend l’armure de son père puis part en direction du camp. Sa famille s'étant rendu compte de son absence renonce à la dénoncer au risque qu'elle soit exécutée. Les ancêtres de la famille Fa sortent de leur sommeil et confient à Mushu, gardien de la famille aujourd’hui dégradé, le soin de réveiller le grand dragon de pierre destiné à protéger Mulan, mais il le pulvérise par inadvertance et trompe le premier ancêtre, chef des autres ancêtres qui lui avait donné cet ordre. Mushu avec Cri-Kee décide alors de partir protéger eux-mêmes Mulan.
Arrivée au camp avec Mushu, Mulan sème le désordre et ne comprend pas les agissements typiquement masculins notamment ceux de Yao, Ling et Chien-Po. Pendant ce temps-là, le général Li, son fils Shang et Chi-Fu débattent de la stratégie militaire à adopter contre les Huns, ils décident que Li partira en premier afin de défendre un village et que Shang le rejoindra plus tard à ce même village pour ensuite terminer sur un col. Par la suite le général Li promeut Shang officier malgré l’opposition de Chi-Fu et repart rejoindre ses troupes. Shang, constatant le désordre, demande le nom du fauteur de trouble et tous les hommes du campement désignent Mulan, celle-ci se présentera sous le nom de Ping. Le lendemain, Shang lance une flèche au haut d’un mât et donne pour but de l’escalader avec deux poids symbolisant la discipline et la force mais aucun des hommes n'y parvient, il leur enseigne aussi le combat et le tir à l’arc. Mulan sur le point d'être chassée et de partir se décide à escalader le mât et réussit.
Les troupes fin prêtes vont vers le front ; pendant les laborieuses heures de marche, pour retrouver de la joie, les soldats chantent et pensent à une fille à aimer mettant Mulan quelque peu mal à l’aise. Mais cette joie est vite interrompue lorsqu’ils découvrent le village dévasté par l'armée des huns. L’un des soldats Chien-po apporte alors le casque du général Li à Shang comprenant ainsi la mort de celui-ci. Shang enfonce l’épée et la surmonte du casque et se recueille un instant avec Mulan comprenant sa douleur. Shang décide alors d’attaquer par le col. Avançant vers leur but, Mushu caché dans la caravane transportant les canons commet la bêtise de lancer du feu, ce qui a pour effet de déclencher l’un de ces canons avertissant ainsi les Huns de leur présence. S’ensuit immédiatement une pluie de flèches contrée par les tirs de canon. Après une courte accalmie, au-delà des nuages de fumée apparaît Shan-Yu ainsi qu’une nuée de soldats chargeant derrière lui. Yao, sur l’ordre de Shang, se prépare à tirer sur Shan-Yu mais Mulan s’élance et prend le canon puis tire sur un pan de la montagne provoquant une avalanche emportant tout le monde. Dans la coulée, Mushu sauve Cri-Kee et Mulan sauve Shang qui sont eux-mêmes sauvés par la flèche attachée à une corde lancée par Yao. Cependant Mulan est blessée.
Peu après, Mulan est soignée, le médecin explique à Shang que Ping est en fait une femme. La punition prévue pour Mulan est la mort mais Shang décide de l'épargner en raison du principe d’une vie pour une vie et ce malgré les contestations de Chi-Fu. Dans le même temps, ce soir-là, Shan-Yu ainsi que quelques-uns de ses hommes s’extirpent de la neige. De retour à Pékin, la victoire est célébrée par la population, à la cité interdite. Mulan essaie en vain de prévenir Shang que les Huns sont sur le palais mais aveuglé par la haine de sa trahison antérieure, Shang ne croit pas Mulan et remet l’épée de Shan-Yu à l’empereur, lorsque d’un coup de choc, l’aigle de Shan-Yu la reprend et ses soldats enlèvent l’empereur. Yao, Ling et Chien-Po se travestissent en femmes et partent avec Mulan reprendre l’empereur, Mulan poursuit son combat avec Shan-Yu sur les toits de la cité interdite. Mushu envoie un grosse fusée de feu d’artifice qui explose contre Shan-Yu. L’empereur, pour la remercier, s’abaisse devant Mulan ainsi que tout le peuple, il lui remet l’épée de Shan-Yu ainsi qu’un médaillon. Après les retrouvailles avec son père, arrive Shang venu lui déclarer sa flamme. Mushu redevient gardien de la famille Fa.

Li Austin Shang est le grand et unique fils du précédent général de l'armée de Chine. Suivant les traces de son père depuis tout petit, le jeune garçon décide lui aussi d'accomplir son destin d'homme et entre à son tour dans l'armée. Doué comme son père et d'une grande fermeté, il est nommé à la tête de la brigade de Mulan pour les former au combat. Cependant, l'attaque des Huns est puissante et l'armée de son père fut entièrement décimé. Sa brigade et lui restent le seul espoir de l'Empereur... 

 
L'histoire comme chacun le sais se déroule en Chine il y a des siècles. L'empereur pour protéger son peuple des invasions barbares a fait construire sur la frontière nord du pays une muraille sensée être indestructible et infranchissable. La paix règnes dans le pays. C’est ici que le film commence. Shan Yu le chef des Huns a décide d'envahir la Chine pour étancher sa soif de pouvoir. C'est un homme cruel et sans pitié. L'alerte est donnée. Dans la cite interdite, lieu de résidence de l'empereur de Chine on se prépare a repousser l’envahisseur. Le roi demande a son conseiller Chi Fu de lever une armée sans tarder. Un homme par foyer devra rejoindre armée chinoise et défendre son pays. Mulan entre alors en scène. En retard comme a son habitude, elle s'habille précipitamment et part rejoindre sa mère et sa grand mère qui l'attende en ville pour la préparer afin qu'elle rencontre la Dame Marieuse. Apres une séance d'habillage et de maquillage, Mulan se rend chez l’entremetteuse non sans oublier le criquet porte bonheur (Cric-kee) que sa grand mère lui a donne. Mais Mulan enchaînera catastrophes sur catastrophes et ferra entrer la Dame Marieuse dans une rage telle que celle ci promet de ne jamais la marier. Mulan n'est pas sitôt rentrée chez elle qu' un envoyé de l'empereur vient annoncer leur conscription aux hommes retenus pour aller combattre. Le père de Mulan est appelé et malgré les protestations de sa fille celui ci ne veux rien entendre: Il partira se battre. Mulan ne supporte pas l’idée que son père aille se faire tuer par honneur. En effet celui ci est blessé a la jambe et ne fera qu'un piètre combattant . La nuit venue Mulan décide de prendre la place de son père et de partir se battre a sa place. Apres une prière aux ancêtres elle se rend dans la pièce ou son père range ses armes et son armure et a l'aide du sabre coupe ses long cheveux. Elle revêt l'armure de son père et sans réveiller ses parents s'introduit dans leur chambre, leur subtilise l'ordre de conscription et part a cheval sous la pluie. Lorsque sa famille découvre qu'elle est partie, il est trop tard. La dénoncer c'est la tuer. La famille se réfugie dans la prière. Les ancêtres décident alors d'intervenir en envoyant le plus puissant des dieux servant la famille Fa : le Grand Dragon de Pierre. C'est Mushu un autre dragon, beaucoup plus petit, qui est charge de le réveiller. Mais en le réveillant Mushu le réduit par mégarde en miettes. Pour ne pas tomber un peu plus en disgrâce au yeux des ancêtres il prend sa place et part rejoindre Mulan. Mulan travestie en homme fait son entrée dans le camps. Sur les conseils de Mushu elle frappe un des autres conscrits et les catastrophes s’enchaînent. Mulan est mise au ban du camps. C'est au tour du capitaine Lee de faire son entrée. Il va former les nouvelles recrues et lorsque celle ci seront prête elle iront rejoindre le gros des troupes pour la bataille. Le premier exercice consiste a aller chercher une flèche plantée en haut d'un immense mat. Les soldats devront grimper le long du tronc avec attache autour de chaque poigne un poids qui représente pour le premier l'ordre et pour le second la discipline. Personne ne réussit. Mais l’entraînement continue. Mulan qui est maintenant détestée par tout les autres conscrits fait pale figure durant l’entraînement tant et si bien que Lee lui ordonne de quitter le camps car elle n'est pas prête a combattre. Mais Mulan ne se décourage pas et pendant que le camps dort, elle essaye de réussir ce que tout le monde a échoue: escalader le mat. Au petit matin elle réussit grâce a son cerveau puisque les poids au lieu être des handicaps deviennent des atouts et l'aident a grimper. Elle est réintégrée et fini brillamment l’entraînement. Apres une scène mémorable dans le lac ou tous les conscrits vont prendre leur bain c'est Mushu qui prend en main le destin du camps. En effet, avec l'aide de Cri-Kee il écrit une lettre adresse a l’administrateur du camps ordonnant aux troupes de rejoindre le front. Toute la compagnie se met en route. En arrivant au point de rendez tout le monde devient muet d’effort: du village qui se dressait auparavant ici, ne reste que des ruines. En cherchant des survivants les soldats trouvent les corps des autres troupes qui les ont précède. Lee est particulièrement touche puisque son père figure parmi les victimes. Mais le temps presse et il faut vite repartir pour sauver l'empereur. Ils s'engagent dans la montagne. Ils sont repères par les Huns et l'affrontement est inévitable. La petite compagnie utilise les canons a disposition mais semble ne toucher aucun des Huns. Il ne reste plus que un canon et les Huns se mettent a charger. Ils sont des milliers face a une petite poignée d'homme pratiquement désarmé. C’est encore Mulan qui va faire preuve du plus de perspicacité. Contrairement aux ordres de son capitaine elle s'empare du canon restant et se précipite au devant des Huns. Au lieu de braquer le canon vers Shan Yu comme l'avait ordonne son supérieur, elle vise une corniche sur la montagne. En tirant, elle déclenche une avalanche gigantesque qui ballait tous les Huns sur son passage. Mulan sauve de justesse Lee mais s’écroule peu après blessée par le chef des Huns. Elle est soignée par le médecin du camps mais son secret est découvert. La punition pour une telle trahison devrait être la mort mais Lee l’épargne puisqu'elle lui a sauver la vie. La troupe abandonne Mulan et repart vers la cite interdite pour recevoir les honneurs puisque les Huns ont été décime.Mulan se préparait a rentrer chez elle lorsqu'elle entend des Huns dans la montagne: ils ne sont pas tous morts. Mulan décide donc d'aller rejoindre son ancien régiment pour les prévenir du danger qui guette l'empereur. Mais redevenue une fille personne ne l’écoute même pas son ancien capitaine. Lorsque les Huns surgissent et kidnappent l'empereur, tout le monde comprend que Mulan avait raison mais il est trop tard. Pourtant c'est encore elle qui va résoudre la crise. Alors que les soldats tentent de défoncer la porte avec une statue faisant office de bélier, Mulan les appelle et les déguise en courtisanes.... les rôles sont a présent inverses: ce sont aux hommes de se faire passer pour des femmes. Ils emploie alors la même technique que Mulan avait employé au début du film: ils grimpe le long de colonne utilisant un foulard comme corde. Ils arrivent a l’intérieur du palais et après avoir mis les gardes hors d’état de nuire, il se précipite vers l'empereur. Celui ci était au balcon menace par Shan Yu. Mais l'empereur digne refusait obstinément de se plier aux exigences du barbare. Lee le sauve juste a temps et les autres soldat le mettent a l'abris mais Mulan et Lee sont privés de retraite et doivent faire face a la fureur de Shan Yu. Alors que celui ci allait tuer Lee Mulan lui révèle qu'elle est le soldat de la montagne et que c'est par conséquent elle qui lui a volé sa victoire. La vengeance du chef des Huns se tourne alors vers elle. Toujours aussi vive d'esprit Mulan élabore rapidement un plan et a l'aide de Mushu: elle entraîne le Hun sur le toi du palais pendant que les petit dragon envoie une fusée de feu d'artifice vers ce dernier. Il part avec elle et explose dans un magnifique feu d'artifice. Mulan redescend et reçoit les honneurs de l'empereur qui tient a la nommer membre de son conseil. Mulan refuse ce grand honneur préférant rentrer chez elle. L'empereur lui offre alors l’épée de Shan Yu et son médaillon comme preuve de ses actes de bravoure. Le capitaine Lee la laisse partir sans pratiquement lui parler. C'est l'empereur lui même qui explique a Lee qu'il ne devrait pas laisser partir une jeune fille aussi époustouflante. Mulan revient chez et retrouve ses parents. Elle est suivit peu après par le capitaine Lee. On devine la suite. Quand a Mushu, lui, par égard au travail qu'il a accompli il est réintègré parmi les gardiens. .